Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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