Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XRCC4Q13426 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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