Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.356e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.24e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.233e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.163e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 SAFB-206ENST00000589006 459 ntTSL 524.48■■□□□ 1.512e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.68e-12■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.418e-12■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 BCAP31-206ENST00000442093 793 ntTSL 227.97■■■□□ 2.078e-12■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 BCAP31-204ENST00000429550 684 ntTSL 325.1■■□□□ 1.618e-12■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 522.98■■□□□ 1.278e-12■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 BCAP31-203ENST00000423827 669 ntTSL 518.46■□□□□ 0.558e-12■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 ARHGDIA-214ENST00000583791 351 ntTSL 225.1■■□□□ 1.616e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 214.05□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)24.77■■□□□ 1.562e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 223.93■■□□□ 1.422e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CABIN1-209ENST00000474981 426 ntTSL 21.48□□□□□ -2.172e-6■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.728e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.48e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 ACSL3-203ENST00000407441 538 ntTSL 34.49□□□□□ -1.698e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 PRKAR1A-218ENST00000589309 407 ntTSL 316.27■□□□□ 0.24e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 GPT2-203ENST00000562132 554 ntTSL 418.34■□□□□ 0.537e-15■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 AKAP1-207ENST00000572156 710 ntTSL 519.72■□□□□ 0.752e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 316.59■□□□□ 0.252e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 QARS-239ENST00000635278 597 ntTSL 216.55■□□□□ 0.246e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 316.3■□□□□ 0.22e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 AKAP1-216ENST00000575322 650 ntTSL 48.23□□□□□ -1.092e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 HNRNPD-204ENST00000503822 607 ntTSL 527.77■■■□□ 2.044e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CTNND1-226ENST00000530720 832 ntTSL 45.53□□□□□ -1.522e-8■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-204ENST00000455768 843 ntTSL 525.01■■□□□ 1.591e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-208ENST00000490447 1321 ntTSL 221.93■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-205ENST00000460547 1674 ntTSL 1 (best)20.58■□□□□ 0.881e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-214ENST00000510102 1639 ntTSL 520.49■□□□□ 0.871e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-212ENST00000503972 933 ntTSL 519.17■□□□□ 0.661e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-203ENST00000416380 1005 ntTSL 515.75■□□□□ 0.111e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-210ENST00000502714 795 ntTSL 414.84□□□□□ -0.031e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 YIPF3-215ENST00000511831 566 ntTSL 412.61□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 MARS-217ENST00000549074 532 ntTSL 423.62■■□□□ 1.373e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 MARS-213ENST00000548674 749 ntTSL 519.09■□□□□ 0.653e-7■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 228.64■■■□□ 2.188e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 323.95■■□□□ 1.428e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.948e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-209ENST00000436461 1614 ntTSL 520.81■□□□□ 0.928e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 319.14■□□□□ 0.658e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 518.76■□□□□ 0.598e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.568e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.548e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 218.3■□□□□ 0.528e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-232ENST00000530445 1217 ntTSL 218.14■□□□□ 0.498e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-207ENST00000430085 1938 ntTSL 217.57■□□□□ 0.48e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 217.04■□□□□ 0.328e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-234ENST00000530616 749 ntTSL 316.81■□□□□ 0.288e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 316.81■□□□□ 0.288e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 215.97■□□□□ 0.158e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 515.96■□□□□ 0.158e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.018e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-210ENST00000443197 4173 ntTSL 513.03□□□□□ -0.328e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.368e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.628e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-220ENST00000482470 3941 ntTSL 211.13□□□□□ -0.638e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 310.94□□□□□ -0.668e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.838e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 CALD1-214ENST00000466704 903 ntTSL 33.99□□□□□ -1.778e-9■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 HDLBP-235ENST00000476807 1070 ntTSL 514.02□□□□□ -0.175e-11■□□□□ 9.6
G3BP1Q13283 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.897e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TMED9-202ENST00000505521 925 ntTSL 223.05■■□□□ 1.287e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 KHK-203ENST00000429697 1303 ntTSL 520.69■□□□□ 0.97e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EPB41L2-208ENST00000524581 3090 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PRPSAP1-201ENST00000324684 1678 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PRPSAP1-203ENST00000435555 916 ntTSL 512.71□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EPB41L2-215ENST00000527017 727 ntTSL 511.59□□□□□ -0.551e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.77e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.347e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.57e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.837e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 IPO5-211ENST00000473582 536 ntTSL 43.1□□□□□ -1.917e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.178e-9■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 424.22■■□□□ 1.476e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TPM4-204ENST00000586499 708 ntTSL 423.59■■□□□ 1.376e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 221.91■■□□□ 1.16e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 GCN1-207ENST00000550471 918 ntTSL 324.67■■□□□ 1.542e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 38.83□□□□□ -15e-9■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)8.04□□□□□ -1.125e-9■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-218ENST00000531416 1969 ntTSL 219.52■□□□□ 0.724e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.564e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.564e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.574e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.974e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.034e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 32.06□□□□□ -2.084e-7■□□□□ 9.5
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 71.7 ms