Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKRN3Q13064 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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