Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMAGPQ0VAQ4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms