Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CACNB2Q08289 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB2Q08289 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms