Protein–RNA interactions for Protein: Q08116

RGS1, Regulator of G-protein signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS1Q08116 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGS1Q08116 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RGS1Q08116 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms