Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC9Q06265 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC9Q06265 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms