Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF17Q02223 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF17Q02223 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms