Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRCDQ00LT1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms