Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFKB2Q00653 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms