Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VLDLRP98155 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms