Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM193AP78312 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms