Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFM1P61960 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UFM1P61960 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
UFM1P61960 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UFM1P61960 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UFM1P61960 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms