Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TMEM258P61165 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms