Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DEFA3P59666 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms