Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPAP53621 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPAP53621 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COPAP53621 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COPAP53621 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms