Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGGT1BP53609 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms