Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB28P51157 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB28P51157 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB28P51157 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB28P51157 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB28P51157 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms