Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A3P48751 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A3P48751 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms