Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NSG1P42857 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NSG1P42857 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms