Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB2P35606 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB2P35606 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms