Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC1P35052 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms