Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRABP1P29762 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms