Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IL3RAP26951 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms