Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR2AP24928 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2AP24928 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms