Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
S100A1P23297 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
S100A1P23297 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
S100A1P23297 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
S100A1P23297 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
S100A1P23297 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
S100A1P23297 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms