Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPN3P20807 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPN3P20807 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms