Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX6O95475 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX6O95475 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX6O95475 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX6O95475 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX6O95475 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms