Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC5O75140 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC5O75140 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms