Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPAG9O60271 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
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