Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX6O43752 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX6O43752 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX6O43752 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX6O43752 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX6O43752 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX6O43752 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX6O43752 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX6O43752 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STX6O43752 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX6O43752 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX6O43752 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX6O43752 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX6O43752 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX6O43752 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX6O43752 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms