Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAA1O43292 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAA1O43292 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms