Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6L4A6NEF3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms