Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC78A2IDD5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms