Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms