Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms