Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THRAP3Q9Y2W1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms