Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJD2Q9UKL4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms