Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSENENQ9NZ42 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms