Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVK13-1Q9NX77 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms