Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRIP3Q9NQ35 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms