Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms