Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCAS3Q9H6U6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms