Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP44Q9H0E7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms