Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms