Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM54Q9BYV2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms