Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOL6Q9BWW8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms