Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HIRIP3Q9BW71 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms