Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF2Q99496 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF2Q99496 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF2Q99496 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms